PCR检测微量熏染因子时，，，，容易由于污染的而导致种种问题，，，，因此，，，，举行PCR操作时，，，，操作职员应该严酷遵守一些操作规程，，，，最洪流平地降低可能泛起的PCR污染或杜绝污染的泛起。。
（1）划分操作区：现在，，，，通俗PCR尚不可做到单人单管，，，，实现完全闭管操作，，，，但无论是否能够抵达单人单管，，，，均要求实验操作在三个差别的区域内举行，，，，PCR的前处置惩罚和后处置惩罚要在差别的隔离区内举行：
  ①  标本处置惩罚区，，，，包括扩增摸板的制备；；
  ②  PCR扩增区，，，，包括反应液的配制和PCR扩增；；
  ③  产品剖析区，，，，凝胶电泳剖析，，，，产品照相及重组克隆的制备。。
各事情区要有一定的隔离，，，，操作器材专用，，，，要有一定的偏向性。。如：标本制备→PCR扩增→产品剖析→产品处置惩罚。。
切记：产品剖析区的产品及器材不要拿到其他两个事情区。。
（2）分装试剂：PCR扩增所需要的试剂均应在装有紫外灯的超净事情台或负压事情台配制和分装。。所有的加样器和吸头需牢靠放于其中，，，，不可用来吸收扩增后的DNA和其他泉源的DNA：
  ①  PCR用水应为高压的双蒸水；；
  ②  引物和dNTP用高压的双蒸水在无PCR扩增产品区配制；；
  ③  引物和dNTP应分装贮存，，，，分装时应标明时间，，，，以备爆发污染时查找缘故原由。。
 (3) 实验操作注重事项 只管扩增序列的残留污染大部分是假阳性反应的缘故原由，，，，样品间的交织污染也是缘故原由之一。。因此，，，，不但要在举行扩增反应是审慎认真，，，，在样品的网络、抽提和扩增的所有环节都应该注重：
  ①  戴一次性手套，，，，若不小心溅上反应液，，，，连忙替换手套；；
  ② 使用一次性吸头，，，，严禁与PCR产品剖析室的吸头混用，，，，吸头不要长时间袒露于空气中，，，，阻止气溶胶的污染；；
  ③  阻止反应液飞溅，，，，翻开反应管时为阻止此种情形，，，，开盖前稍离心网络液体于管底。。若不小心溅到手套或桌面上，，，，应连忙替换手套并用稀酸擦拭桌面；；
  ④  操作多份样品时，，，，制备反应混淆液，，，，先将dNTP、缓冲液、引物和酶混淆好，，，，然后分装，，，，这样即可以镌汰操作，，，，阻止污染，，，，又可以增添反应的准确度；；
  ⑤ 最后加入反应模板，，，，加入后盖紧反应管；；
  ⑥  操作时设立阴阳性比照和空缺比照，，，，即可验证PCR反应的可靠性，，，，又可以协助判断扩增系统的可信性；；
  ⑦  尽可能用可替换或可高压处置惩罚的加样器，，，，由于加样器最容易受产品气溶胶或标本DNA的污染，，，，最好使用可替换或高压处置惩罚的加样器。。如没有这种特殊的加样器，，，，至少PCR操作历程中加样器应该专用，，，，不可交织使用，，，，尤其是PCR产品剖析所用加样器不可拿到其它两个区；；
  ⑧  重复实验，，，，验证效果，，，，慎下结论。。